引起肝功能異常的原因很多，可概括為以下幾類：

1．感染寄生蟲、鉤端螺旋體、細菌、病毒均可造成肝臟損害。

2．化學藥品中毒。如四氯化碳、氯仿、磷、銻、砷劑等，往往可破壞肝細胞的酶系統，引起代謝障礙，或使氧化磷酸化過程受到抑制，atp生成減少，導致肝細胞變性壞死；有些藥物，如氯丙嗪、對氨柳酸、異菸肼、某些碘胺藥物和抗菌素(如四環素)，即使治療劑量就可以引起少數人的肝臟損害，這可能與過敏有關。

3．免疫功能異常。肝病可以引起免疫反應異常，免疫反應異常又是引起肝臟損害的重要原因之一。

4．營養不足缺乏膽鹼、甲硫氨酸。這是因為肝內脂肪的運輸須先轉變為磷脂（主要為卵磷脂），而膽鹼是卵磷脂的必需組成部分。甲硫氨酸供給合成膽鹼的甲基。當這些物質缺乏時，脂肪從肝中移除受阻，造成肝的脂肪性變。

5．膽道阻塞膽道阻塞。使膽汁淤積，如時間過長，可因滯留的膽汁對肝細胞的損害作用和肝內擴張的膽管對血竇壓迫造成肝缺血，而引起肝細胞變性和壞死。

6．血液循環障礙如慢性心力衰竭時，引起肝淤血和缺氧。

7．腫瘤如肝癌對肝組織的破壞。

8．遺傳缺陷。有些肝病是由于遺傳缺陷而引起的遺傳性疾病。