非淋癥狀潛伏期可有數(shù)天至數(shù)月，但多數(shù)為1至3周。常表現(xiàn)為尿道內(nèi)的不適，發(fā)癢、燒灼感和排尿困難、疼痛、少數(shù)有尿頻。尿道口輕度紅腫，分泌物稀薄、量少，為漿液性和膿性，多需用手?jǐn)D壓尿道才發(fā)現(xiàn)有分泌物溢出。長時(shí)間不排尿或早晨首次排尿前可能見到溢出尿道口的分泌物污染內(nèi)褲，結(jié)成粘糊狀，可封住尿道口（俗稱為“糊口”現(xiàn)象）。有30%-40%的患者可無任何癥狀，也有不少病人癥狀不典型，有約一成左右的患者可同時(shí)合并淋球菌感染。

1、非淋菌性尿道炎潛伏期：1-4周。

2、非淋菌性尿道炎癥狀起病不如淋病急，癥狀拖延，時(shí)輕時(shí)重，但比淋病輕。約50%的病人有尿痛、尿道癢等癥狀。初診時(shí)很易被漏診。女性非淋菌性尿道炎癥狀更輕，無尿痛或輕微尿痛，可出現(xiàn)少量分泌物。有時(shí)宮頸也有炎癥或糜爛，宮頸分泌物中有多數(shù)分葉型白細(xì)胞。

3、非淋菌性尿道炎癥狀表現(xiàn)為尿道分泌物少，稀薄，粘液性或粘膜膿性。較長時(shí)間不排尿(如晨起)尿道外口可溢出少量稀薄分泌物。有時(shí)僅表現(xiàn)為晨起痂膜封住尿道口或污染內(nèi)褲。檢查時(shí)，需由后向前按擠前尿道才可能有少許分泌物由尿道口溢出。有時(shí)病人有癥狀無分泌物，也可無癥狀而有分泌物。

4、非淋菌性尿道炎癥狀常與淋病同時(shí)感染。前者先出現(xiàn)淋病癥狀，經(jīng)抗淋病治療后，淋球菌被青霉素殺死，而衣原體、支原體依然存在。在感染1-3周后發(fā)病。臨床上很易被誤認(rèn)為淋病未治愈或復(fù)發(fā)。

5、非淋菌性尿道炎癥狀處理不當(dāng)或治療不及時(shí)可引起并發(fā)癥（1%）。如急性附睪炎、前列腺炎、結(jié)腸炎、咽炎。女性宮頸炎、宮頸糜爛、前庭大腺炎、炎、輸卵管炎、盆腔炎、異位妊娠、不育等。

6、新生兒通過感染的產(chǎn)道、生后3-13d可發(fā)生眼結(jié)膜炎，眼部有粘液膿性分泌物，也可無分泌物。但多不侵犯角膜。生后2-3周可發(fā)生肺炎。癥狀不斷加重，呼吸急促為其特點(diǎn)，但不發(fā)熱。其中半數(shù)患兒有眼結(jié)膜炎。

7、極少數(shù)病人可伴發(fā)Reifer綜合征：尿道炎、關(guān)節(jié)炎、角膜炎、結(jié)合膜炎及皮疹。