卵巢巧克力囊腫可不是因為巧克力吃多了而跑到卵巢當中去了，它是子宮內膜異位癥的一種表現。卵巢巧克力囊腫也會有癌變的可能。

有數據表明，卵巢巧克力囊腫約有1%的惡變率。雖然手術治療可對卵巢巧克力囊腫惡變進行清除，但是如果患者在患病之后能夠早發現早治療，避免因自身原因使卵巢巧克力囊腫的病程增長，導致卵巢巧克力囊腫的性質產生變化，應該比卵巢巧克力囊腫發生改變后再進行治療有意義的多，因此一旦患上了卵巢巧克力囊腫，需要定期檢查，確認囊腫是否有增大惡變的跡象，這種定期檢查隨訪可能需要伴隨患者終生。

治療卵巢巧克力囊腫并非易事，因其受內分泌功能的控制，所以只要卵巢存在激素的分泌就不會停止，而內膜異位的現象也會一直在進行中，所以卵巢巧克力囊腫疾病是治好了也非常容易復發。有的人就說了，切除卵巢不就可以徹底根治了嗎？但是這種殺雞取卵的做法，嚴重的影響到了女性朋友的生活質量。所以如果是較小的囊腫，在不影響受孕的前提下進行隨診觀察就可以了，但是如果卵巢巧克力囊腫的直徑已經超過了四厘米，則必須進行手術，因為繼續在增大的囊腫，隨時都有“爆炸”的危險。