惡性葡萄胎發生的機會為5%～20%，是指葡萄胎的水泡樣組織超過子宮腔范圍，侵入子宮肌層深部或在其他部位發生轉移的葡萄胎。葡萄胎惡變成惡性葡萄胎或絨毛膜癌，多數在葡萄胎清除后6個月內發生，但亦有葡萄胎未排出之前就發生惡變者。