牡蠣粉雖然功效眾多，但是干吃需要在醫生指導下用藥，以免產生不良的的反應，不利于牡蠣粉發揮藥效以及身體的恢復。通常情況下牡蠣粉可以用酒、溫水、湯等送服。

1、心脾氣痛，有痰。用牡蠣煅成粉，酒送服二錢。

2、瘧疾寒熱。用牡蠣粉、杜仲，等分為末，加蜜做成丸子，如梧子大。每服五十丸，溫水送下。

3、氣虛盜汗。用牡蠣粉、杜仲，等分為末。每服一匙，酒送下。

4、產后盜汗。用牡蠣粉、麥麩（炒黃）等分。每服一錢，豬肉湯調下。

5、消渴飲水。用黃泥封固牡蠣，煅赤，研為末。每服一錢，活鯽魚煎湯調下。

除了口服，牡蠣粉也可以同其他的藥物搭配用來外敷治療。

1、陰囊水腫用牡蠣煅粉二兩、干姜（炮）一兩，共研為末，冷水調糊敷上。不久，囊熱如火。藥干即換，至小便通暢末，冷水調糊敷上。不久，囊熱如火。藥干即換，至小便通暢為愈。又方：改冷水調糊為蔥汁，白面同調。不兒不用干姜。

2、刀傷出血。用牡蠣粉敷涂。

3、癰腫初起。用牡蠣粉末調水涂搽。藥干即換。