1、羊水穿刺：羊水穿刺對于唐氏綜合征的檢出率達到99%以上，由于能收集胎兒全部染色體并進行遺傳學分析，因此除了21三體綜合征，羊水檢驗對于18三體綜合征、13三體綜合征、脆X綜合征等染色體疾病的診斷都有較高的檢出率；同時還能篩查一些出生缺陷等疾病。
羊水穿刺對于唐氏綜合征的檢出率達到99%以上，但有流產風險。
羊水穿刺最佳檢測孕周為16-21周，不過這是一項侵入性檢查，可能會對孕婦和胎兒造成一定影響，其主要的不良反應包括出血、感染、羊水漏、呼吸窘迫、早產、胎兒損傷、流產等，其中最令人擔心的就是流產。不過，目前羊水穿刺的安全系數已經大大提高，近年來有文獻報道它導致的流產率僅為1/1600，并不算高。
2、無創DNA產前檢測：由于在孕婦外周血中有4%到8%是胎兒游離的DNA，只要采集媽媽的外周血，提取出這些游離的DNA，就能判斷胎兒是否患有唐氏綜合征，這種方法的準確度高，可達99%以上，避免因誤診、失誤等原因造成孕婦流產。
無創DNA產前檢測診斷唐氏綜合征的準確率達99%以上。
無創DNA產前檢測的最佳檢測孕周為12-26周。一般而言，當懷孕12周以上時，可以利用該方法進行唐氏綜合癥的篩查。
